Zaborskie Towarzystwo Naukowe nawiązując do tradycji pracy organicznej i społecznikowskiej zapisanej na kartach historii tej ziemi w XIX i XX wieku pragnie poinformować o swoich celach na wiek XXI zawartych w § 8 statutu:

1. Inspirowanie i prowadzenie badań naukowych, ze szczególnym uwzględnieniem Ziemi Zaborskiej.
2. Upowszechnianie dostępu do informacji i wiedzy.
3. Promowanie idei społeczeństwa obywatelskiego, obrony praw człowieka i obywatela.